Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms