Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCO2Q9BYV7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BCO2Q9BYV7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms