Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms