Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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