Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms