Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SALL3Q9BXA9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms