Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms