Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms