Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms