Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms