Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms