Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX18Q96RF0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms