Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms