Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms