Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG3Q96JB2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms