Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGAM5Q96HS1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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