Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C18orf8Q96DM3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms