Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms