Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFHD2Q96C19 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD2Q96C19 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms