Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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UBE2E3Q969T4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E3Q969T4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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UBE2E3Q969T4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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UBE2E3Q969T4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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UBE2E3Q969T4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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UBE2E3Q969T4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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UBE2E3Q969T4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E3Q969T4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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