Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms