Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms