Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms