Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms