Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms