Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms