Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms