Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BEST4Q8NFU0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms