Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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