Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGDNQ8NEJ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGDNQ8NEJ9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms