Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms