Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms