Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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C9orf40Q8IXQ3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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