Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC84Q86UT8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms