Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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TRAPPC6BQ86SZ2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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TRAPPC6BQ86SZ2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TRAPPC6BQ86SZ2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TRAPPC6BQ86SZ2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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