Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms