Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP53Q70EK8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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USP53Q70EK8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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USP53Q70EK8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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USP53Q70EK8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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USP53Q70EK8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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USP53Q70EK8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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USP53Q70EK8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP53Q70EK8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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