Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6P435 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6P435 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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