Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EDC4Q6P2E9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms