Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms