Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms