Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms