Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIRMAQ69YN4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms