Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms