Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FAM78BQ5VT40 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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