Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAPC4Q5SXM2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms