Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms