Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms