Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms