Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDRF1Q3B7T1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms